順位表
2023年 12月 2日 シーズン終了
| | 勝点 | Ｊ３ | 勝 | 分 | 敗 | 得点 | 失点 | 点差 | 試合 | 平均 |
| 1 | 73 | 愛媛 | 21 | 10 | 7 | 59 | 48 | 11 | 38 | 1.92 |
| 2 | 62 | 鹿児島 | 18 | 8 | 12 | 58 | 41 | 17 | 38 | 1.63 |
| 3 | 62 | 富山 | 19 | 5 | 14 | 59 | 48 | 11 | 38 | 1.63 |
| 4 | 59 | 今治 | 16 | 11 | 11 | 54 | 42 | 12 | 38 | 1.55 |
| 5 | 57 | 奈良 | 15 | 12 | 11 | 45 | 32 | 13 | 38 | 1.50 |
| 6 | 56 | 鳥取 | 14 | 14 | 10 | 57 | 52 | 5 | 38 | 1.47 |
| 7 | 56 | 八戸 | 15 | 11 | 12 | 49 | 47 | 2 | 38 | 1.47 |
| 8 | 54 | 岐阜 | 14 | 12 | 12 | 44 | 35 | 9 | 38 | 1.42 |
| 9 | 54 | 松本 | 15 | 9 | 14 | 51 | 47 | 4 | 38 | 1.42 |
| 10 | 54 | 岩手 | 15 | 9 | 14 | 48 | 49 | -1 | 38 | 1.42 |
| 11 | 53 | ＦＣ大阪 | 14 | 11 | 13 | 41 | 38 | 3 | 38 | 1.39 |
| 12 | 52 | ＹＳ横浜 | 14 | 10 | 14 | 48 | 50 | -2 | 38 | 1.37 |
| 13 | 51 | 沼津 | 15 | 6 | 17 | 48 | 48 | 0 | 38 | 1.34 |
| 14 | 50 | 長野 | 13 | 11 | 14 | 52 | 60 | -8 | 38 | 1.32 |
| 15 | 47 | 福島 | 12 | 11 | 15 | 37 | 42 | -5 | 38 | 1.24 |
| 16 | 44 | 讃岐 | 11 | 11 | 16 | 29 | 45 | -16 | 38 | 1.16 |
| 17 | 43 | 琉球 | 12 | 7 | 19 | 43 | 61 | -18 | 38 | 1.13 |
| 18 | 41 | 相模原 | 9 | 14 | 15 | 44 | 48 | -4 | 38 | 1.08 |
| 19 | 39 | 宮崎 | 9 | 12 | 17 | 31 | 52 | -21 | 38 | 1.03 |
| 20 | 31 | 北九州 | 7 | 10 | 21 | 33 | 45 | -12 | 38 | 0.82 |
2部昇格 入れ替え戦4部降格
昇格と降格
- 1、2位 愛媛 - 来季Ｊ２リーグに昇格。
- 該当なし - 4部リーグ（JFL）チームと入れ替え戦。
- 該当なし - 来季 4部リーグ（JFL）に降格。
※ライセンスのないHondaとブリオベッカ浦安がJFLで優勝・2位となったため、自動降格と入れ替え戦はなくなった。
新規加入
奈良（2022シーズン ＪＦＬ優勝）
ＦＣ大阪（2022シーズン ＪＦＬ準優勝）
月間最優秀選手
| 2月・3月 | 宮市剛（いわてグルージャ盛岡） |
| 4月 | 浅川隼人（奈良クラブ） |
| 5月 | 福田翔生（ＹＳ横浜） |
| 6月 | 佐々木陽次（カターレ富山） |
| 7月 | 深堀隼平（愛媛FC） |
| 8月 | ンドカ チャールス（FC岐阜） |
| 9月 | 木匠貴大（FC大阪） |
| 10月 | 米澤令衣（鹿児島ユナイテッドFC） |
| 11月・12月 | マテウス・レイリア（カターレ富山） |
月間最優秀監督
| 2月・3月 | 松原良香（いわてグルージャ盛岡） |
| 4月 | フリアン・マリン・バサロ（奈良クラブ） |
| 5月 | 大嶽直人（鹿児島ユナイテッドFC） |
| 6月 | 上野優作（FC岐阜） |
| 7月 | 石丸清隆（愛媛FC） |
| 8月 | 依田光正（福島ユナイテッドFC） |
| 9月 | 大島康明（鹿児島ユナイテッドFC） |
| 10月 | 倉貫一毅（ＹＳ横浜） |
| 11月・12月 | 石﨑信弘（ヴァンラーレ八戸） |
