決勝トーナメントグループステージ1回戦予選1回戦進出
マルセイユ(フランス)、
オトヴィダベリ(スウェーデン)、
デリー(アイルランド)、
ヴィスラ・クラクフ(ポーランド)、
ブレンビー(デンマーク)、
ラピド・ブカレスト(ルーマニア)、
クラブ・ブルージュ(ベルギー)、
リエパヤ・メタルグス(ラトビア)、
オセール(フランス)、
ニューカッスル(イングランド)、
トラブゾンスポル(トルコ)、
カイセリスポル(トルコ)、
シオン(スイス)、
エトニコス・アクナス(キプロス)、
ランダーズ(デンマーク)、
グラスポッパーズ(スイス)、
ディナモ・ブカレスト(ルーマニア)、
FCバーゼル(スイス)、
パルチザン・ベオグラード(セルビア・モンテネグロ)、
レヴァディア・タリン(エストニア)、
ハプ・テルアビブ(イスラエル)、
OBオーゼンセ(デンマーク)、
モルデ(ノルウェー)、
ヘルタ・ベルリン(ドイツ)、
IKスタート(ノルウェー)、
CSKAソフィア(ブルガリア)、
ロコモティヴ・ソフィア(ブルガリア)、
アルトメディア(スロバキア)、
スラヴィア・プラハ(チェコ共和国)、
シェルノモレット(ウクライナ)、
ルービン・カザン(ロシア)、
リテス・ロヴェチ(ブルガリア)
予選 2回戦
| 2006.8.8 1st-leg |
| オモニア・ニコシア | 0 | - | 0 | リテス・ロヴェチ |
| OFKベオグラード | 1 | - | 0 | オセール |
| 2006.8.10 1st-leg |
| ルービン・カザン | 3 | - | 0 | BATEボリソフ |
| シェルノモレット | 0 | - | 0 | ヴィスラ・ポロック |
| カルヴァン | 0 | - | 2 | スラヴィア・プラハ |
| KFティラナ | 0 | - | 2 | カイセリスポル |
| アルトメディア | 2 | - | 1 | ディナモ・ミンスク |
| ブネイ・エフダ | 0 | - | 2 | ロコモティヴ・ソフィア |
| ルーセラーレ | 2 | - | 1 | エトニコス・アクナス |
| CSKAソフィア | 0 | - | 0 | ハイデュク・クラ |
| リード | 0 | - | 0 | シオン |
| ハプ・テルアビブ | 1 | - | 2 | ドムザレ |
| モルデ | 0 | - | 0 | スコント・リガ |
| OBオーゼンセ | 1 | - | 0 | ラネリ |
| ランダーズ | 3 | - | 1 | カウナス |
| SKブラン | 3 | - | 3 | オトヴィダベリ |
| IKスタート | 1 | - | 0 | ドロゲダ |
| ジンブル・チシナウ | 0 | - | 0 | リエパヤ・メタルグス |
| ヘルタ・ベルリン | 1 | - | 0 | アメリ |
| トウェンテ | 1 | - | 1 | レヴァディア・タリン |
| ヤングボーイズ | 3 | - | 3 | マルセイユ |
| ヴェンツピルス | 0 | - | 1 | ニューカッスル |
| フローラ・タリン | 0 | - | 0 | ブレンビー |
| スドゥヴァ | 0 | - | 2 | クラブ・ブルージュ |
| ディナモ・ブカレスト | 1 | - | 0 | ベイト・エルサレム |
| APOELニコシア | 1 | - | 1 | トラブゾンスポル |
| FCバーゼル | 1 | - | 0 | ファドゥーツ |
| サラエヴォ | 1 | - | 0 | ラピド・ブカレスト |
| フェヘルヴァル | 1 | - | 1 | グラスポッパーズ |
| パルチザン・ベオグラード | 2 | - | 1 | マリボル |
| マテルスブルグ | 1 | - | 1 | ヴィスラ・クラクフ |
| グレトナ | 1 | - | 5 | デリー |
| 2006.8.24 2nd-leg |
| エトニコス・アクナス | 5 | - | 0 | ルーセラーレ |
| ドムザレ | 0 | - | 3 | ハプ・テルアビブ |
| ヴィスラ・ポロック | 1 | - | 1 | シェルノモレット |
| カイセリスポル | 3 | - | 1 | KFティラナ |
| カウナス | 1 | - | 0 | ランダーズ |
| オトヴィダベリ | 1 | - | 1 | SKブラン |
| ドロゲダ | 0 | - | 0 | IKスタート |
| リエパヤ・メタルグス | 3 | - | 0 | ジンブル・チシナウ |
| ニューカッスル | 0 | - | 0 | ヴェンツピルス |
| トラブゾンスポル | 1 | - | 0 | APOELニコシア |
| ファドゥーツ | 2 | - | 1 | FCバーゼル |
| リテス・ロヴェチ | 2 | - | 1 | オモニア・ニコシア |
| ディナモ・ミンスク | 2 | - | 3 | アルトメディア |
| デリー | 2 | - | 2 | グレトナ |
| ラピド・ブカレスト | 2 | - | 0 | サラエヴォ |
| アメリ | 2 | - | 2 | ヘルタ・ベルリン |
| スラヴィア・プラハ | 1 | - | 0 | カルヴァン |
| グラスポッパーズ | 2 | - | 0 | フェヘルヴァル |
| マリボル | 1 | - | 1 | パルチザン・ベオグラード |
| ブレンビー | 4 | - | 0 | フローラ・タリン |
| オセール | 5 | - | 1 | OFKベオグラード |
| スコント・リガ | 1 | - | 2 | モルデ |
| レヴァディア・タリン | 1 | - | 0 | トウェンテ |
| BATEボリソフ | 0 | - | 2 | ルービン・カザン |
| ハイデュク・クラ | 1 | - | 1 | CSKAソフィア |
| ヴィスラ・クラクフ | 1 | - | 0 | マテルスブルグ |
| クラブ・ブルージュ | 5 | - | 2 | スドゥヴァ |
| ラネリ | 1 | - | 5 | OBオーゼンセ |
| シオン | 1 | - | 0 | リード |
| マルセイユ | 0 | - | 0 | ヤングボーイズ |
| ベイト・エルサレム | 1 | - | 1 | ディナモ・ブカレスト |
| ロコモティヴ・ソフィア | 4 | - | 0 | ブネイ・エフダ |
予選 1回戦
| 2006.7.13 1st-leg |
| ヒベルニアンズ | 0 | - | 4 | ディナモ・ブカレスト |
| ザグレブ | 1 | - | 1 | ディナモ・ミンスク |
| ランダーズ | 1 | - | 0 | IAアクラネス |
| オトヴィダベリ | 4 | - | 0 | エトゼラ・エテルブルック |
| ロコモティヴ・ソフィア | 2 | - | 0 | マケドニヤ |
| FCバーゼル | 3 | - | 1 | トボル・コスタナイ |
| レヴァディア・タリン | 2 | - | 0 | ハカ・ヴァルケアコスキー |
| ヴァルテクス | 1 | - | 1 | KFティラナ |
| ウィペスト | 0 | - | 4 | ファドゥーツ |
| ゲフル | 1 | - | 2 | ラネリ |
| IFKエーテボリ | 0 | - | 1 | デリー |
| サラエヴォ | 3 | - | 0 | レンジャーズ |
| フェヘルヴァル | 1 | - | 0 | カイラト・アルマティ |
| グレントラン | 0 | - | 1 | ブラン |
| アルトメディア | 2 | - | 0 | WITジョージア |
| リエカ | 2 | - | 2 | オモニア・ニコシア |
| BATEボリソフ | 2 | - | 0 | ニストル・オタシ |
| ライル | 0 | - | 0 | スドゥヴァ |
| ラピド・ブカレスト | 5 | - | 0 | スリエマ・ワンダラーズ |
| ブレンビー | 3 | - | 1 | ヴァルア |
| リン | 1 | - | 1 | フローラ・タリン |
| コッパー | 0 | - | 1 | リテス・ロヴェチ |
| MIKAアシュタラク | 1 | - | 3 | ヤングボーイズ |
| ヴェンツピルス | 2 | - | 1 | GIゴタ |
| カルヴァン | 1 | - | 0 | スパルタク・トルナヴァ |
| APOELニコシア | 3 | - | 1 | ムラタ |
| アメリ | 0 | - | 1 | バナンツ |
| ポータダウン | 1 | - | 3 | カウナス |
| ヴァルダル・スコピエ | 1 | - | 2 | ルーセラーレ |
| HJKヘルシンキ | 1 | - | 1 | ドロゲダ |
| スカラ | 0 | - | 1 | IKスタート |
| ディナモ・ティラナ | 0 | - | 1 | CSKAソフィア |
| ジンブル・チシナウ | 1 | - | 1 | カラバク |
| ジュネッセ | 0 | - | 2 | スコント・リガ |
| オラシェ | 0 | - | 2 | ドムザレ |
| 2006.7.27 2nd-leg |
| ラネリ | 0 | - | 0 | ゲフル |
| デリー | 1 | - | 0 | IFKエーテボリ |
| レンジャーズ | 0 | - | 2 | サラエヴォ |
| カイラト・アルマティ | 2 | - | 1 | フェヘルヴァル |
| ブラン | 1 | - | 0 | グレントラン |
| ドムザレ | 5 | - | 0 | オラシェ |
| オモニア・ニコシア | 2 | - | 1 | リエカ |
| ニストル・オタシ | 0 | - | 1 | BATEボリソフ |
| スドゥヴァ | 2 | - | 1 | ライル |
| エトゼラ・エテルブルック | 0 | - | 3 | オトヴィダベリ |
| スリエマ・ワンダラーズ | 0 | - | 1 | ラピド・ブカレスト |
| ヴァルア | 0 | - | 0 | ブレンビー |
| フローラ・タリン | 0 | - | 0 | リン |
| リテス・ロヴェチ | 5 | - | 0 | コッパー |
| ヤングボーイズ | 1 | - | 0 | MIKAアシュタラク |
| GIゴタ | 0 | - | 2 | ヴェンツピルス |
| ムラタ | 0 | - | 4 | APOELニコシア |
| バナンツ | 1 | - | 2 | アメリ |
| カウナス | 1 | - | 0 | ポータダウン |
| WITジョージア | 2 | - | 1 | アルトメディア |
| ルーセラーレ | 5 | - | 1 | ヴァルダル・スコピエ |
| ドロゲダ | 3 | - | 1 | HJKヘルシンキ |
| IKスタート | 3 | - | 0 | スカラ |
| CSKAソフィア | 4 | - | 1 | ディナモ・ティラナ |
| カラバク | 1 | - | 2 | ジンブル・チシナウ |
| スコント・リガ | 3 | - | 0 | ジュネッセ |
| ディナモ・ブカレスト | 5 | - | 1 | ヒベルニアンズ |
| ディナモ・ミンスク | 0 | - | 0 | ザグレブ |
| IAアクラネス | 2 | - | 1 | ランダーズ |
| スパルタク・トルナヴァ | 0 | - | 1 | カルヴァン |
| マケドニヤ | 1 | - | 1 | ロコモティヴ・ソフィア |
| トボル・コスタナイ | 0 | - | 0 | FCバーゼル |
| ハカ・ヴァルケアコスキー | 1 | - | 0 | レヴァディア・タリン |
| KFティラナ | 2 | - | 0 | ヴァルテクス |
| ファドゥーツ | 0 | - | 1 | ウィペスト |
