概要
決勝トーナメントとグループステージ1・2回戦と予備予選グループステージ進出
オーランド・パイレーツ（南アフリカ）、
ザマレク（エジプト）、
エスペランス（チュニジア）、
セウェ（コートジボワール）、
レクレティボ・リボロ（アンゴラ）、
コトン（カメルーン）、
アルアハリ（エジプト）、
レオパーズ（コンビ共和国）
2回戦
勝者はグループステージへ進出。敗者はアフリカ連盟カップへ進む。
| 2013.4.20 1st-leg |
| オーランド・パイレーツ | 3 | - | 1 | マゼンベ |
| ザマレク | 1 | - | 1 | セントジョージ |
| ベジャイア | 0 | - | 0 | エスペランス |
| 2013.4.21 1st-leg |
| FUSラバト | 1 | - | 1 | セウェ |
| エヌグ・レンジャース | 0 | - | 0 | レクレティボ・リボロ |
| コトン | 3 | - | 0 | ステイドマリエン |
| ビゼルティン | 0 | - | 0 | アルアハリ |
| レオパーズ | 3 | - | 1 | セティフ |
| 2013.5.3 2nd-leg |
| セティフ | 3 | - | 1 | レオパーズ |
| 2013.5.4 2nd-leg |
| エスペランス | 1 | - | 0 | ベジャイア |
| ステイドマリエン | 0 | - | 0 | コトン |
| セウェ | 0 | - | 0 | FUSラバト |
| レクレティボ・リボロ | 3 | - | 1 | エヌグ・レンジャース |
| 2013.5.5 2nd-leg |
| アルアハリ | 2 | - | 1 | ビゼルティン |
| セントジョージ | 2 | - | 2 | ザマレク |
| マゼンベ | 1 | - | 0 | オーランド・パイレーツ |
| PK |
| セティフ | 4 | - | 5 | レオパーズ |
1回戦
予備予選を勝ち上がった 19チームと 1回戦から出場の 13チーム、
計 32チームが 16組に分かれてホーム＆アウェイで対戦。勝者は 2回戦進出。
| 2013.3.15 1st-leg |
| FUSラバト | 3 | - | 0 | ユニオン・ドゥアラ |
| ザマレク | 1 | - | 0 | ビータ・クラブ |
| ベジャイア | 0 | - | 0 | コトコ |
| 2013.3.16 1st-leg |
| イエネガ | 2 | - | 1 | セティフ |
| カノ・ビラーズ | 4 | - | 1 | レオパーズ |
| ザナコ | 0 | - | 1 | オーランド・パイレーツ |
| セウェ | 4 | - | 1 | アルヒラル |
| ツスカー | 1 | - | 2 | アルアハリ |
| モチュディ・センターチーフス | 0 | - | 1 | マゼンベ |
| 2013.3.17 1st-leg |
| AFADジェカノー | 0 | - | 1 | コトン |
| アゴスト | 0 | - | 1 | エスペランス |
| カサ・スポーツ | 1 | - | 2 | ステイドマリエン |
| セントジョージ | 2 | - | 0 | ジョリバ |
| ビゼルティン | 3 | - | 0 | ダイナモス |
| レクレティボ・リボロ | 2 | - | 1 | アルマリカ |
| ヴィタロ | 0 | - | 0 | エヌグ・レンジャース |
| 2013.4.5 2nd-leg |
| アルヒラル | 3 | - | 1 | セウェ |
| セティフ | 4 | - | 2 | イエネガ |
| 2013.4.6 2nd-leg |
| アルマリカ | 1 | - | 2 | レクレティボ・リボロ |
| エスペランス | 1 | - | 0 | アゴスト |
| オーランド・パイレーツ | 2 | - | 1 | ザナコ |
| ステイドマリエン | 2 | - | 0 | カサ・スポーツ |
| ビータ・クラブ | 0 | - | 0 | ザマレク |
| レオパーズ | 3 | - | 0 | カノ・ビラーズ |
| 2013.4.7 2nd-leg |
| アルアハリ | 2 | - | 0 | ツスカー |
| エヌグ・レンジャース | 2 | - | 0 | ヴィタロ |
| コトコ | 1 | - | 1 | ベジャイア |
| コトン | 2 | - | 1 | AFADジェカノー |
| ジョリバ | 1 | - | 1 | セントジョージ |
| ダイナモス | 1 | - | 0 | ビゼルティン |
| マゼンベ | 6 | - | 0 | モチュディ・センターチーフス |
| ユニオン・ドゥアラ | 1 | - | 0 | FUSラバト |
予備予選
38チームが 19組に分かれてホーム＆アウェイで対戦。勝者は 1回戦進出。
| 2013.2.15 1st-leg |
| FUSラバト | 1 | - | 0 | レアル・バンジュール |
| ビゼルティン | 1 | - | 1 | アルイチハド |
| ベジャイア | 3 | - | 0 | オリンピック・ニアメ |
| 2013.2.16 1st-leg |
| APR | 1 | - | 2 | ヴィタロ |
| アゴスト | 4 | - | 2 | アデマ |
| オーランド・パイレーツ | 5 | - | 0 | シャバル・クラブ |
| カノ・ビラーズ | 5 | - | 1 | オリンピック・レアル・バンギ |
| サンミシェル・ユナイテッド | 1 | - | 4 | ツスカー |
| ザナコ | 3 | - | 2 | ムババネ・スワローズ |
| ジャムフリ | 0 | - | 3 | セントジョージ |
| モガレブ・テトゥアン | 1 | - | 0 | カサ・スポーツ |
| 2013.2.17 1st-leg |
| AFADジェカノー | 5 | - | 1 | ダイヤモンド・スターズ |
| ASPAC | 1 | - | 1 | イエネガ |
| コトコ | 7 | - | 0 | エラ・ンゲマ |
| コトン | 0 | - | 0 | ウガンダ税務局 |
| ザマレク | 7 | - | 0 | ガゼル |
| シンバ | 0 | - | 1 | レクレティボ・リボロ |
| ダイナモス | 3 | - | 0 | レソト博物局 |
| ビータ・クラブ | 3 | - | 0 | ダイナミック・トゴレス |
| ホロヤ | 0 | - | 0 | セウェ |
| マクサケン | 0 | - | 1 | モチュディ・センターチーフス |
| ユニオン・ドゥアラ | 2 | - | 1 | LISCR |
| レオパーズ | 2 | - | 0 | ムナナ |
| 2013.3.1 2nd-leg |
| オリンピック・ニアメ | 0 | - | 0 | ベジャイア |
| 2013.3.2 2nd-leg |
| ウガンダ税務局 | 0 | - | 0 | コトン |
| ガゼル | 0 | - | 0 | ザマレク |
| シャバル・クラブ | 0 | - | 4 | オーランド・パイレーツ |
| セウェ | 3 | - | 0 | ホロヤ |
| ダイヤモンド・スターズ | 1 | - | 1 | AFADジェカノー |
| ツスカー | 3 | - | 0 | サンミシェル・ユナイテッド |
| モチュディ・センターチーフス | 1 | - | 0 | マクサケン |
| レアル・バンジュール | 2 | - | 1 | FUSラバト |
| 2013.3.3 2nd-leg |
| アルイチハド | 0 | - | 1 | ビゼルティン |
| LISCR | 0 | - | 1 | ユニオン・ドゥアラ |
| アデマ | 1 | - | 0 | アゴスト |
| イエネガ | 1 | - | 1 | ASPAC |
| エラ・ンゲマ | 0 | - | 1 | コトコ |
| オリンピック・レアル・バンギ | 0 | - | 0 | カノ・ビラーズ |
| カサ・スポーツ | 1 | - | 0 | モガレブ・テトゥアン |
| セントジョージ | 5 | - | 0 | ジャムフリ |
| ダイナミック・トゴレス | 1 | - | 2 | ビータ・クラブ |
| ムナナ | 1 | - | 0 | レオパーズ |
| ムババネ・スワローズ | 0 | - | 0 | ザナコ |
| レクレティボ・リボロ | 4 | - | 0 | シンバ |
| レソト博物局 | 1 | - | 0 | ダイナモス |
| ヴィタロ | 0 | - | 1 | APR |
| PK |
| ウガンダ税務局 | 3 | - | 4 | コトン |
| カサ・スポーツ | 3 | - | 1 | モガレブ・テトゥアン |
| イエネガ | 5 | - | 4 | ASPAC |
